По словам специалистов, строительство Крымского моста оказало благотворное влияние на экологическую обстановку в Керченском заливе и в Азовском море. Показатели донных отложений, взятые в течение 2018 года, указывают, что на протяжении нескольких лет число вредных веществ в морской воде планомерно снижается. За предыдущие годы содержание таких соединений в воде, как полихлорированные бифенилы, мышьяк и тяжёлые металлы снизились вдвое. Многие участки всё ещё загрязнены, но уже сейчас промысловая рыба не столь отравлена продуктами химической промышленности. Наиболее чистым районом Азовского моря является юго-восточная его часть в районе Таманского полуострова.
Учёные отмечают, очищение вод произошло, в том числе, и благодаря появлению Крымского моста. Этому поспособствовало упорядочивание судоходства, сокращение использование маломерных судов, а также ужесточение контроля за сбросом отработанных вод кораблями. Помимо этого, в данном районе увеличился сток пресной воды из реки Кубань, сообщается на портале .
