«Это один из важнейших наборов данных, которые существуют о происхождении пандемии COVID-19. Мы чрезвычайно благодарны за то, что эти данные существуют и были предоставлены», — говорит соавтор-корреспондент Флоранс Дебарр из Французского национального центра научных исследований (CNRS). Эта статья добавляет еще один слой к накапливающимся доказательствам, которые все указывают на один и тот же сценарий: инфицированные животные были выведены на рынок в середине-конце ноября 2019 года, что и спровоцировало пандемию.
1 января 2020 года, после того как животных увезли и всего через несколько часов после закрытия рынка, следователи из китайского CDC отправились на рынок, чтобы собрать образцы. Они взяли мазки с полов, стен и других поверхностей прилавков; они вернулись через несколько дней, чтобы сосредоточиться на поверхностях в прилавках, где продают диких животных, таких как клетки и тележки, используемые для перемещения животных, а затем также собрали образцы из стоков и канализации.
Они провели метатранскриптомное секвенирование образцов, метод, направленный на получение всех последовательностей РНК (и который также может улавливать ДНК) из всех организмов, присутствующих в образцах: вирусов, бактерий, растений, животных, людей. Китайская команда CDC под руководством Лю Цзюня опубликовала свои данные и результаты в 2023 году в журнале Nature . Однако статья оставила нерешенными точные идентичности видов животных, обнаруженных в данных, которые могли бы представлять собой вероятных промежуточных хозяев. Китайский CDC поделился своими данными секвенирования в публичных и открытых репозиториях.
Согласно последнему анализу этих данных, опубликованному в Cell , SARS-CoV-2 присутствовал в некоторых из тех же прилавков, что и дикие животные, продаваемые на рынке, включая енотовидных собак (небольшие лисоподобные животные с отметинами, похожими на енотов) и циветт (небольшие плотоядные млекопитающие, родственные мангустам и гиенам). В некоторых случаях генетический материал вируса SARS-CoV-2 и этих животных был даже обнаружен на тех же мазках. Точные виды животных были идентифицированы путем генотипирования их митохондриальных геномов в образцах.
«Многие из ключевых видов животных были уничтожены до прибытия китайских команд CDC, поэтому у нас нет прямых доказательств того, что животные были инфицированы. Мы видим ДНК и РНК-призраки этих животных в образцах окружающей среды, и некоторые из них находятся в стойл», — говорит Дебарр.
Международная группа также провела эволюционный анализ самых ранних вирусных геномов, зарегистрированных во время пандемии, включая эти экологические последовательности, и вывела наиболее вероятные генотипы-предшественники вируса, который заразил людей и привел к пандемии COVID-19. Результаты показывают, что до вспышки на рынке было очень мало инфицированных людей, если таковые вообще были. Это согласуется с перетоками от животных к людям на рынке. Также могли иметь место перетоки ограниченного воздействия в непосредственной восходящей торговле животными.
«В этой статье мы показываем, что последовательности, связанные с рынком, соответствуют возникновению рынка. Основное разнообразие SARS-CoV-2 присутствовало на рынке с самого начала», — говорит Дебарр.
Новое исследование остановилось на коротком списке видов животных на мокром рынке, которые были обнаружены совместно или близко к образцам вируса, которые могли представлять собой наиболее вероятных промежуточных хозяев для SARS-CoV-2. Обыкновенная енотовидная собака, вид, восприимчивый к SARS-CoV-2 и являвшийся переносчиком SARS-CoV в 2003 году, оказалась самым генетически распространенным животным в образцах с рыночных прилавков с дикими животными. Генетический материал от масковых пальмовых циветт, которые также были связаны с более ранней вспышкой SARS-CoV, также был обнаружен в прилавке с РНК SARS-CoV-2. Другие виды, такие как седая бамбуковая крыса и малайские дикобразы, также присутствовали в образцах, положительных по SARS-CoV-2, а также множество других видов.
Хотя данные не могут доказать, были ли заражены одно или несколько из этих животных, анализы группы дают четкий список видов, которые с наибольшей вероятностью могли быть переносчиками вируса, а также генетическую информацию, которую можно использовать для отслеживания места их происхождения.
Исследователи подчеркивают важность понимания истоков пандемии COVID-19, особенно в свете других недавних побочных эффектов, таких как распространение вирусов птичьего гриппа среди крупного рогатого скота в Соединенных Штатах.
Интернет, Общество с ограниченной ответственностью «Три «Ч», Центр Т, Боровой Константин Натанович, Транс, Автономная некоммерческая организация информационных и правовых услуг «Гражданская инициатива против экологической преступности», Общество с ограниченной ответственностью «ЛИЗА НОРМ», Фонд «Центр гражданского анализа и независимых исследований «ГРАНИ», Автономная некоммерческая организация «Научный центр международных исследований «ПИР» признаны в РФ иностранными агентами.
