Группа ученых из Технологического университета представила инновационный метод анализа крови, благодаря которому стало возможным выявлять следы опухолевой ДНК, даже если ее доля в образце составляет всего около 5%. Результаты данного исследования были опубликованы в научном журнале Briefings in Bioinformatics (BBio).
Анализ крови на циркулирующую опухолевую ДНК на сегодняшний день считается одним из самых многообещающих инструментов для диагностики и мониторинга рака. Тем не менее, после успешного лечения уровень раковой ДНК в крови значительно снижается, что затрудняет отслеживание состояния пациента.
Как отмечают ученые, «для сравнения: большинство существующих методов требуют, чтобы раковая ДНК составляла не менее 15-20% от общего объема генетического материала».
Разработанный метод, получивший название BayesCNA, способен обнаруживать слабые сигналы опухоли даже в тех образцах, где это было практически невозможно ранее.
По словам авторов исследования, новая технология применяет статистический алгоритм, который позволяет отделять редкие фрагменты опухолевой ДНК от значительного объема генетического материала здоровых клеток. Это, в свою очередь, дает возможность исследователям получать более детальную информацию о структуре опухоли и отслеживать, как она изменяется со временем.
Разработчики подчеркивают, что такой подход может существенно снизить инвазивность мониторинга онкологических заболеваний. На сегодняшний день для тщательного изучения опухоли часто требуется проведение биопсии, тогда как анализ крови можно осуществлять регулярно — каждые несколько недель. Это позволит врачам быстрее оценивать эффективность лечения и, при необходимости, вносить коррективы в терапию.
Новый метод уже продемонстрировал высокую эффективность в работе с образцами низкого качества, которые ранее считались малоинформативными. В дальнейшем планируется разработка инструментов, способных выявлять дополнительные особенности опухолей по анализу крови, что может оказать влияние на их реакцию на лечение.
